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バイオマスタウンとは、バイオマスの発生から利用まで最適なプロセスで結ぶ総合的な利活用システムが構築された地域、またはこれから行われることが見込まれる地域をいう。2010年に300地域程度が目標。
「バイオマスタウン構想書」は、バイオマスタウンを形成しようとする市町村とその地域の関係者が協力して作成し、内閣府、総務省、文部科学省、農林水産省、経済産業省、国土交通省、環境省の合意の上で、バイオマス・ニッポン総合戦略推進会議事務局において基準に合致しているか否かを検討された後、バイオマス情報ヘッドクォーターに公表される。2007年3月28日の第18回公表までで93地域(うち3地域は更新)が公表されている。